Війна за приміщення церкви святого Стефана розпочалася давно. Спочатку там молилися православні МП, але згодом прихильники УПЦ Київського патріархату стали вимагати почергового богослужіння в храмі та почали відправляти там службу.
Остаточно доступ до культової споруди в селі послідовники Кирила втратили, коли в лютому 2017-го місцева церковна громада вирішила перейти під юрисдикцію Київського патріархату. Кілька місяців прихожани УПЦ збирались на літургію в будинку священика, але згодом втратили доступ і до нього.
Відтак, вірні УПЦ МП взялися за спорудження тут нової церкви, ділянку під яку пожертвував один із парафіян. Будувати новий храм допомагали Київська митрополія УПЦ, благодійний фонд «Фавор», що діє з благословення Священного синоду УПЦ, та Почаївська лавра. На відкриття нової церкви в Котюжинах приїхав митрополит Тернопільський та Кременецький УПЦ Сергій, який освятив храм.
Наразі в різних судових інстанціях триває розгляд справи щодо володіння сільським храмом.